Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
GABRPO00591 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GABRPO00591 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GABRPO00591 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GABRPO00591 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GABRPO00591 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRPO00591 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms