Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms