Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms