Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms