Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms