Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms