Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms