Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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