Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms