Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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