Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms