Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms