Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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GIN1Q9NXP7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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GIN1Q9NXP7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GIN1Q9NXP7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GIN1Q9NXP7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GIN1Q9NXP7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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