Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms