Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHST12Q9NRB3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms