Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PFDN4Q9NQP4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PFDN4Q9NQP4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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PFDN4Q9NQP4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PFDN4Q9NQP4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PFDN4Q9NQP4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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