Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 FAAP24-202ENST00000588258 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC24A3Q9HC58 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms