Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms