Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms