Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms