Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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