Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHP1Q99653 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms