Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms