Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms