Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRAMD1AQ96CP6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms