Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms