Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.3 ms