Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms