Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPBP1Q92547 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms