Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHD5Q8TDI0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms