Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms