Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms