Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms