Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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