Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LETMD1Q6P1Q0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LETMD1Q6P1Q0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LETMD1Q6P1Q0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LETMD1Q6P1Q0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LETMD1Q6P1Q0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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