Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms