Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SAMD13Q5VXD3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SAMD13Q5VXD3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SAMD13Q5VXD3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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