Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms