Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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