Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms