Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms