Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUS10Q3MIT2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms