Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms