Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms