Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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