Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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