Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms