Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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