Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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