Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDH18Q13634 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CDH18Q13634 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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